化學發光成像系統的工作原理主要基于化學發光反應。具體來說，當特定的化學物質與待測樣品中的目標分子發生反應時，會釋放出能量并產生熒光或發光現象。這種發光現象是由于化學反應中電子的激發和躍遷所產生的。

在化學發光成像系統中，先選擇適當的化學發光反應體系和相應的化學染料或標記物。這些染料或標記物通常是熒光染料或放射性標記物，它們能夠與目標分子發生特異性結合。當這些化學物質被引入到待測樣品中時，通過適當的刺激方式（如光激發、溫度變化或電子激發等）觸發化學發光反應。

一旦化學發光反應發生，產生的熒光或發光信號會被成像設備捕捉和記錄。這些成像設備通常包括熒光顯微鏡、攝影機、熒光掃描儀等，它們具有高靈敏度和高分辨率，能夠檢測到微弱的發光信號。

成像設備會將捕捉到的發光信號轉化為數字信號，并通過計算機進行處理和分析。通過圖像處理軟件，可以對發光信號進行定量和定位分析，從而得到關于目標分子在樣品中的分布、濃度等信息。

需要注意的是，化學發光成像系統的工作效果受多種因素的影響，如反應條件、化學發光體系的選擇、成像設備的性能等。因此，在實際應用中，需要根據具體的實驗需求和樣品特性來優化系統參數和實驗條件，以獲得準確、可靠的成像結果。

綜上所述，化學發光成像系統通過利用化學發光反應產生的發光信號，結合高靈敏度的成像設備，實現了對生物樣品中目標分子的定量和定位分析，為生物學和醫學等領域的研究提供了有力工具。